Juntamente com o biogás é captado vapor de água que condensa após o resfriamento do biogás na tubulação de captação (Figura D.42). Esse condensado deve ser removido do sistema de coleta e deve ser devidamente tratado juntamente com o chorume produzido no aterro.
O controle do condensado tem início no sistema de coleta onde são utilizados conectores e tubos inclinados para permitir a drenagem em tanques e, após a coleta, o condensado é removido. Os métodos para disposição do condensado são: descarga no sistema público de esgoto, sistema de tratamento local, e recirculação para o aterro sanitário.
O melhor método dependerá das características do condensado (em função dos componentes do lixo local), do custo do tratamento, além da legislação e regulação vigentes.